Pada September 1934, wakil penjajah, Residen Peyrouton memerintahkan Bourguiba dihadkan di Borj-Leboeuf, bersempadan Gurun Sahara, sehingga April 1936. Selepas kebangkitan popular pada 9 April 1938, tentera penjajah melepaskan tembakan ke atas penunjuk perasaan yang membunuh dan mencederakan beratus-ratus orang awam, Bourguiba sekali lagi dipenjarakan pada 10 Jun 1939 bersama-sama dengan kumpulan militan atas tuduhan berkomplot terhadap keselamatan negara dan hasutan perang saudara.